Seinen Namen verdankt das am Douro-Ufer gelegene São João da Pesqueira einem natürlichen Stausee, dessen grosser Fischreichtum ihn zu einem Paradies für die Fischer machte, die ihn daraufhin "pesqueira" (Fischgrund) nannten.
König Alfons III. (Asturien) eroberte den Ort im 9. Jahrhundert von den Mauren und ließ ihn neu besiedeln. Zwischen 1055 und 1065 erhielt der Ort seine ersten Stadtrechte von Ferdinand I. (León). Die ersten Stadtrechte im unabhängigen Königreich Portugal bekam São João da Pesqueira 1198 von König Sancho I., die 1376 bestätigt und 1510 erneuert wurden.
Zu sehen gibt es:
1) Die barocke Kirche Igreja da Misericórdia mit schönen Azulejos. Sie wurde im 16. Jahrhundert errichtet und birgt u. a. barocke Altäre aus vergoldetem Holz (Talha dourada) und Altarretabeln des Rokoko. Das Portal der Kirche ist gleich neben dem historischen Krankenhaus.
2) Das Krankenhaus aus dem 16. Jahrhundert am zentralen Platz des Ortes, der Praça da República.
3) romantische Gässchens
4) Tor zum Hauptplatz von der Rückseite.
5) Die Marktstände wurden gleich wieder weggeräumt, als unsere Gruppe wieder weg ging.
6) Rua dos Gatos, das Katzengässchen
7) Casa do Cabo, Palácio da Justicia