Le château de Wildegg a été construit vers 1200 après J.-C. par les Habsbourg. Avec le Château de Habsbourg au nord et celui de Brunegg à l'est, il faisait partie du système de fortifications des Habsbourg contre les Kybourg, dont le château de Lenzbourg était situé plus au sud. En 1483, Kaspar Effinger, noble provincial argovien, acquit le domaine du château. De 1483 à 1912, le château de Wildegg fut la résidence de la famille Effinger. Le domaine comprenait un potager et un jardin d'agrément, une roseraie, des vignes, une terrasse sous les tilleuls, des forêts, une ferme et une auberge. Tous ces bâtiments sont aujourd’hui encore en grande partie conservés. Autrefois, des manufactures faisaient également partie du domaine. En 1912, Julie von Effinger, dernière héritière de Wildegg, légua le domaine du château, y compris le mobilier et les terres, à la Confédération suisse.
Depuis le 1er janvier 2011, le château appartient à une fondation créée par le canton d’Argovie. À cette même date, la gestion du musée a été reprise par le Musée d’Argovie.